Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
RxraP28700 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
RxraP28700 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
RxraP28700 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RxraP28700 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
RxraP28700 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
RxraP28700 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RxraP28700 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
RxraP28700 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RxraP28700 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RxraP28700 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
RxraP28700 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
RxraP28700 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
RxraP28700 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RxraP28700 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RxraP28700 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
RxraP28700 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RxraP28700 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RxraP28700 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RxraP28700 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RxraP28700 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RxraP28700 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RxraP28700 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RxraP28700 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RxraP28700 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
RxraP28700 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RxraP28700 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RxraP28700 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RxraP28700 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RxraP28700 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RxraP28700 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RxraP28700 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RxraP28700 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RxraP28700 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RxraP28700 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RxraP28700 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
RxraP28700 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RxraP28700 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
RxraP28700 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RxraP28700 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
RxraP28700 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
RxraP28700 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
RxraP28700 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
RxraP28700 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RxraP28700 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
RxraP28700 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RxraP28700 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RxraP28700 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
RxraP28700 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RxraP28700 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RxraP28700 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RxraP28700 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RxraP28700 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RxraP28700 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RxraP28700 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RxraP28700 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RxraP28700 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RxraP28700 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RxraP28700 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RxraP28700 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RxraP28700 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RxraP28700 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RxraP28700 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RxraP28700 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RxraP28700 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RxraP28700 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
RxraP28700 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RxraP28700 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RxraP28700 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RxraP28700 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RxraP28700 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RxraP28700 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RxraP28700 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RxraP28700 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RxraP28700 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
RxraP28700 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RxraP28700 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RxraP28700 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RxraP28700 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RxraP28700 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
RxraP28700 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RxraP28700 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RxraP28700 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
RxraP28700 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
RxraP28700 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
RxraP28700 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
RxraP28700 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
RxraP28700 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RxraP28700 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RxraP28700 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RxraP28700 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RxraP28700 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RxraP28700 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RxraP28700 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RxraP28700 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RxraP28700 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RxraP28700 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RxraP28700 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RxraP28700 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RxraP28700 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms