Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
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Hoxd10P28359 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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Hoxd10P28359 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC14□□□□□ -0.17
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Hoxd10P28359 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Hoxd10P28359 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Hoxd10P28359 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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