Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Pde6aP27664 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Pde6aP27664 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Pde6aP27664 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Pde6aP27664 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Pde6aP27664 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Pde6aP27664 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Pde6aP27664 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Pde6aP27664 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
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Pde6aP27664 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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