Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
PparaP23204 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PparaP23204 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PparaP23204 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PparaP23204 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
PparaP23204 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
PparaP23204 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
PparaP23204 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PparaP23204 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
PparaP23204 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PparaP23204 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PparaP23204 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PparaP23204 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PparaP23204 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PparaP23204 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PparaP23204 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PparaP23204 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PparaP23204 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
PparaP23204 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PparaP23204 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
PparaP23204 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PparaP23204 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PparaP23204 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PparaP23204 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PparaP23204 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PparaP23204 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PparaP23204 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PparaP23204 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PparaP23204 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PparaP23204 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PparaP23204 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PparaP23204 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PparaP23204 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PparaP23204 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PparaP23204 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PparaP23204 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
PparaP23204 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
PparaP23204 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PparaP23204 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PparaP23204 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PparaP23204 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PparaP23204 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PparaP23204 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PparaP23204 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PparaP23204 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PparaP23204 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PparaP23204 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PparaP23204 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PparaP23204 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
PparaP23204 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PparaP23204 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PparaP23204 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PparaP23204 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PparaP23204 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PparaP23204 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PparaP23204 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PparaP23204 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PparaP23204 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PparaP23204 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PparaP23204 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
PparaP23204 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PparaP23204 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PparaP23204 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PparaP23204 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PparaP23204 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PparaP23204 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PparaP23204 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
PparaP23204 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
PparaP23204 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PparaP23204 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PparaP23204 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PparaP23204 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PparaP23204 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PparaP23204 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
PparaP23204 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
PparaP23204 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PparaP23204 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PparaP23204 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PparaP23204 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PparaP23204 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PparaP23204 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PparaP23204 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PparaP23204 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PparaP23204 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PparaP23204 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
PparaP23204 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PparaP23204 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
PparaP23204 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PparaP23204 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PparaP23204 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PparaP23204 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PparaP23204 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PparaP23204 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PparaP23204 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PparaP23204 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PparaP23204 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PparaP23204 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PparaP23204 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PparaP23204 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PparaP23204 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms