Protein–RNA interactions for Protein: P21952

Pou3f1, POU domain, class 3, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f1P21952 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pou3f1P21952 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms