Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Fcer1aP20489 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Fcer1aP20489 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Fcer1aP20489 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Fcer1aP20489 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fcer1aP20489 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fcer1aP20489 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fcer1aP20489 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fcer1aP20489 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fcer1aP20489 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fcer1aP20489 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fcer1aP20489 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fcer1aP20489 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fcer1aP20489 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fcer1aP20489 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fcer1aP20489 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fcer1aP20489 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fcer1aP20489 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fcer1aP20489 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fcer1aP20489 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fcer1aP20489 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fcer1aP20489 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fcer1aP20489 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fcer1aP20489 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fcer1aP20489 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fcer1aP20489 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fcer1aP20489 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fcer1aP20489 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fcer1aP20489 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fcer1aP20489 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fcer1aP20489 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fcer1aP20489 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fcer1aP20489 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fcer1aP20489 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fcer1aP20489 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fcer1aP20489 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fcer1aP20489 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fcer1aP20489 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fcer1aP20489 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fcer1aP20489 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fcer1aP20489 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fcer1aP20489 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fcer1aP20489 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fcer1aP20489 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fcer1aP20489 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Fcer1aP20489 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fcer1aP20489 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fcer1aP20489 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fcer1aP20489 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fcer1aP20489 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fcer1aP20489 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fcer1aP20489 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fcer1aP20489 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fcer1aP20489 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fcer1aP20489 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fcer1aP20489 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fcer1aP20489 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fcer1aP20489 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Fcer1aP20489 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fcer1aP20489 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fcer1aP20489 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Fcer1aP20489 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fcer1aP20489 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fcer1aP20489 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fcer1aP20489 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fcer1aP20489 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Fcer1aP20489 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fcer1aP20489 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fcer1aP20489 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Fcer1aP20489 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Fcer1aP20489 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fcer1aP20489 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fcer1aP20489 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fcer1aP20489 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fcer1aP20489 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Fcer1aP20489 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fcer1aP20489 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fcer1aP20489 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Fcer1aP20489 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Fcer1aP20489 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fcer1aP20489 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fcer1aP20489 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fcer1aP20489 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Fcer1aP20489 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fcer1aP20489 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fcer1aP20489 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fcer1aP20489 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fcer1aP20489 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fcer1aP20489 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fcer1aP20489 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fcer1aP20489 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fcer1aP20489 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fcer1aP20489 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fcer1aP20489 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fcer1aP20489 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fcer1aP20489 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fcer1aP20489 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fcer1aP20489 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fcer1aP20489 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Fcer1aP20489 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms