Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TP20293 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TP20293 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TP20293 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
TP20293 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TP20293 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TP20293 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TP20293 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TP20293 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
TP20293 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TP20293 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TP20293 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TP20293 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TP20293 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TP20293 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TP20293 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TP20293 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TP20293 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TP20293 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TP20293 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
TP20293 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TP20293 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TP20293 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TP20293 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TP20293 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TP20293 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TP20293 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TP20293 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TP20293 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TP20293 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TP20293 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TP20293 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TP20293 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
TP20293 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
TP20293 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
TP20293 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
TP20293 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TP20293 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TP20293 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TP20293 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TP20293 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
TP20293 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TP20293 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC12□□□□□ -0.49
TP20293 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TP20293 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC12□□□□□ -0.49
TP20293 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TP20293 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TP20293 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TP20293 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TP20293 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC12□□□□□ -0.49
TP20293 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
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TP20293 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
TP20293 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TP20293 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TP20293 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TP20293 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TP20293 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TP20293 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TP20293 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
TP20293 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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TP20293 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TP20293 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TP20293 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
TP20293 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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TP20293 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TP20293 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TP20293 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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TP20293 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
TP20293 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC12□□□□□ -0.49
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TP20293 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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TP20293 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TP20293 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TP20293 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TP20293 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
TP20293 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TP20293 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TP20293 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TP20293 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TP20293 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TP20293 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
TP20293 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TP20293 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TP20293 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TP20293 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TP20293 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TP20293 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TP20293 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
TP20293 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TP20293 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TP20293 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TP20293 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
TP20293 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TP20293 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TP20293 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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