Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Pou5f1P20263 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pou5f1P20263 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pou5f1P20263 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pou5f1P20263 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pou5f1P20263 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Pou5f1P20263 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Pou5f1P20263 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pou5f1P20263 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pou5f1P20263 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pou5f1P20263 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pou5f1P20263 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pou5f1P20263 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pou5f1P20263 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pou5f1P20263 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pou5f1P20263 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pou5f1P20263 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pou5f1P20263 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pou5f1P20263 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pou5f1P20263 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pou5f1P20263 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Pou5f1P20263 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pou5f1P20263 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pou5f1P20263 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pou5f1P20263 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Pou5f1P20263 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pou5f1P20263 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pou5f1P20263 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pou5f1P20263 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pou5f1P20263 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pou5f1P20263 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pou5f1P20263 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Pou5f1P20263 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pou5f1P20263 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pou5f1P20263 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pou5f1P20263 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pou5f1P20263 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Pou5f1P20263 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pou5f1P20263 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pou5f1P20263 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pou5f1P20263 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pou5f1P20263 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Pou5f1P20263 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pou5f1P20263 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pou5f1P20263 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pou5f1P20263 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pou5f1P20263 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pou5f1P20263 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pou5f1P20263 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Pou5f1P20263 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Pou5f1P20263 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pou5f1P20263 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pou5f1P20263 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pou5f1P20263 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pou5f1P20263 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pou5f1P20263 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Pou5f1P20263 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pou5f1P20263 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pou5f1P20263 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pou5f1P20263 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pou5f1P20263 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pou5f1P20263 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pou5f1P20263 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pou5f1P20263 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pou5f1P20263 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pou5f1P20263 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pou5f1P20263 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pou5f1P20263 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pou5f1P20263 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pou5f1P20263 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pou5f1P20263 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pou5f1P20263 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pou5f1P20263 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pou5f1P20263 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pou5f1P20263 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Pou5f1P20263 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pou5f1P20263 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pou5f1P20263 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pou5f1P20263 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pou5f1P20263 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pou5f1P20263 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pou5f1P20263 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Pou5f1P20263 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pou5f1P20263 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pou5f1P20263 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Pou5f1P20263 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pou5f1P20263 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pou5f1P20263 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pou5f1P20263 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pou5f1P20263 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pou5f1P20263 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Pou5f1P20263 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pou5f1P20263 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pou5f1P20263 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Pou5f1P20263 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pou5f1P20263 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Pou5f1P20263 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pou5f1P20263 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pou5f1P20263 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Pou5f1P20263 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms