Protein–RNA interactions for Protein: P20181

Ntf3, Neurotrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf3P20181 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ntf3P20181 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ntf3P20181 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ntf3P20181 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ntf3P20181 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ntf3P20181 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ntf3P20181 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ntf3P20181 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ntf3P20181 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ntf3P20181 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ntf3P20181 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ntf3P20181 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ntf3P20181 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ntf3P20181 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ntf3P20181 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ntf3P20181 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ntf3P20181 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ntf3P20181 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ntf3P20181 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ntf3P20181 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ntf3P20181 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ntf3P20181 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ntf3P20181 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ntf3P20181 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ntf3P20181 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ntf3P20181 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ntf3P20181 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ntf3P20181 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ntf3P20181 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ntf3P20181 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ntf3P20181 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ntf3P20181 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ntf3P20181 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ntf3P20181 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ntf3P20181 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ntf3P20181 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ntf3P20181 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ntf3P20181 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ntf3P20181 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ntf3P20181 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ntf3P20181 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ntf3P20181 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ntf3P20181 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ntf3P20181 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ntf3P20181 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ntf3P20181 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ntf3P20181 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ntf3P20181 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ntf3P20181 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ntf3P20181 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ntf3P20181 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ntf3P20181 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ntf3P20181 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ntf3P20181 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ntf3P20181 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ntf3P20181 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ntf3P20181 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ntf3P20181 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ntf3P20181 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ntf3P20181 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ntf3P20181 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ntf3P20181 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ntf3P20181 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ntf3P20181 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ntf3P20181 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ntf3P20181 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ntf3P20181 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ntf3P20181 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ntf3P20181 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ntf3P20181 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ntf3P20181 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ntf3P20181 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ntf3P20181 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ntf3P20181 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ntf3P20181 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ntf3P20181 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ntf3P20181 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ntf3P20181 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ntf3P20181 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ntf3P20181 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ntf3P20181 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ntf3P20181 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ntf3P20181 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ntf3P20181 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ntf3P20181 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ntf3P20181 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ntf3P20181 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ntf3P20181 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ntf3P20181 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ntf3P20181 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ntf3P20181 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ntf3P20181 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ntf3P20181 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ntf3P20181 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ntf3P20181 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ntf3P20181 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ntf3P20181 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ntf3P20181 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ntf3P20181 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ntf3P20181 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms