Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
VimP20152 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
VimP20152 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
VimP20152 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
VimP20152 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
VimP20152 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
VimP20152 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
VimP20152 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
VimP20152 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
VimP20152 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
VimP20152 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
VimP20152 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VimP20152 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
VimP20152 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VimP20152 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VimP20152 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VimP20152 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VimP20152 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VimP20152 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VimP20152 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VimP20152 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
VimP20152 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
VimP20152 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
VimP20152 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VimP20152 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VimP20152 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VimP20152 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
VimP20152 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VimP20152 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VimP20152 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VimP20152 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
VimP20152 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
VimP20152 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VimP20152 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
VimP20152 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VimP20152 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VimP20152 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
VimP20152 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VimP20152 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
VimP20152 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
VimP20152 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VimP20152 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VimP20152 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VimP20152 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
VimP20152 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VimP20152 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
VimP20152 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
VimP20152 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VimP20152 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VimP20152 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VimP20152 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VimP20152 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VimP20152 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
VimP20152 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
VimP20152 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VimP20152 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VimP20152 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VimP20152 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VimP20152 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
VimP20152 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
VimP20152 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
VimP20152 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VimP20152 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
VimP20152 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
VimP20152 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
VimP20152 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
VimP20152 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
VimP20152 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
VimP20152 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
VimP20152 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
VimP20152 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
VimP20152 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
VimP20152 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VimP20152 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VimP20152 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
VimP20152 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VimP20152 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VimP20152 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VimP20152 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VimP20152 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VimP20152 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
VimP20152 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VimP20152 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VimP20152 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VimP20152 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VimP20152 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VimP20152 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
VimP20152 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
VimP20152 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VimP20152 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VimP20152 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VimP20152 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VimP20152 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VimP20152 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VimP20152 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VimP20152 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VimP20152 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VimP20152 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VimP20152 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
VimP20152 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms