Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PdgfaP20033 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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PdgfaP20033 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
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PdgfaP20033 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
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PdgfaP20033 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Gm11361-201ENSMUST00000223428 607 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Prr9-201ENSMUST00000070284 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Gm12940-202ENSMUST00000137236 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
PdgfaP20033 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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