Protein–RNA interactions for Protein: P18533

Ig heavy chain V region 733, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18533 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P18533 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
P18533 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
P18533 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
P18533 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
P18533 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
P18533 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
P18533 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P18533 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P18533 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
P18533 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
P18533 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P18533 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P18533 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P18533 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P18533 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
P18533 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P18533 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P18533 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
P18533 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P18533 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
P18533 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P18533 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P18533 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P18533 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
P18533 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P18533 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P18533 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P18533 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P18533 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P18533 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P18533 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P18533 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P18533 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P18533 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P18533 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P18533 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P18533 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P18533 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P18533 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P18533 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
P18533 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P18533 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
P18533 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P18533 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
P18533 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
P18533 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
P18533 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
P18533 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
P18533 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P18533 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
P18533 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
P18533 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
P18533 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P18533 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P18533 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
P18533 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
P18533 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P18533 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P18533 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P18533 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P18533 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
P18533 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P18533 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P18533 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P18533 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P18533 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P18533 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
P18533 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P18533 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P18533 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P18533 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P18533 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P18533 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P18533 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
P18533 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P18533 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
P18533 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P18533 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
P18533 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
P18533 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
P18533 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P18533 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
P18533 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P18533 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P18533 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
P18533 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
P18533 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
P18533 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
P18533 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
P18533 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
P18533 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
P18533 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
P18533 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
P18533 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P18533 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P18533 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P18533 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P18533 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
P18533 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
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