Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 AC154828.2-201ENSMUST00000220908 1070 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
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Hoxb1P17919 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Hoxb1P17919 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Hoxb1P17919 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Hoxb1P17919 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Hoxb1P17919 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Hoxb1P17919 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms