Protein–RNA interactions for Protein: P0DP28

Calm3, Calmodulin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calm3P0DP28 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Calm3P0DP28 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Calm3P0DP28 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Calm3P0DP28 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Calm3P0DP28 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Calm3P0DP28 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Calm3P0DP28 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Calm3P0DP28 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Calm3P0DP28 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Calm3P0DP28 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Calm3P0DP28 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Calm3P0DP28 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Calm3P0DP28 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Calm3P0DP28 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Calm3P0DP28 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Calm3P0DP28 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Calm3P0DP28 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Calm3P0DP28 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Calm3P0DP28 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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