Protein–RNA interactions for Protein: P09021

Hoxa5, Homeobox protein Hox-A5, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa5P09021 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 AC154634.3-201ENSMUST00000224589 736 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Hoxa5P09021 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Gm12106-201ENSMUST00000116006 1200 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
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Hoxa5P09021 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Hoxa5P09021 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Hoxa5P09021 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Hoxa5P09021 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Hoxa5P09021 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Hoxa5P09021 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Hoxa5P09021 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Hoxa5P09021 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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