Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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