Protein–RNA interactions for Protein: O70237

Gfi1b, Zinc finger protein Gfi-1b, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1bO70237 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Gfi1bO70237 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
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Gfi1bO70237 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Gfi1bO70237 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gfi1bO70237 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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