Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sp100O35892 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sp100O35892 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sp100O35892 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Sp100O35892 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sp100O35892 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sp100O35892 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sp100O35892 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sp100O35892 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Sp100O35892 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sp100O35892 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
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Sp100O35892 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sp100O35892 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Sp100O35892 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sp100O35892 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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