Protein–RNA interactions for Protein: O09005

Degs1, Sphingolipid delta(4)-desaturase DES1, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Degs1O09005 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Degs1O09005 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Degs1O09005 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Degs1O09005 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Degs1O09005 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Degs1O09005 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Degs1O09005 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Degs1O09005 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Degs1O09005 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74 ms