Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Eftud2O08810 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms