Protein–RNA interactions for Protein: O08795

Prkcsh, Glucosidase 2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcshO08795 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Gckr-202ENSMUST00000201166 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Mc4r-201ENSMUST00000057942 2758 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Ctso-201ENSMUST00000029649 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 AC164092.1-201ENSMUST00000215635 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Mov10-207ENSMUST00000168015 3460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Mov10-201ENSMUST00000002297 3498 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Gm9220-201ENSMUST00000190721 2544 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Cir1-201ENSMUST00000058615 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Dis3l2-202ENSMUST00000168237 3154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Rbm8a-201ENSMUST00000048915 2608 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Gatb-203ENSMUST00000107674 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Gm7340-201ENSMUST00000119729 2752 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Gfm2-201ENSMUST00000022170 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Nit1-201ENSMUST00000111289 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Gm15953-201ENSMUST00000117656 1732 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Aqp7-202ENSMUST00000054945 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkcshO08795 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PrkcshO08795 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PrkcshO08795 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PrkcshO08795 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PrkcshO08795 Ralgps2-203ENSMUST00000171292 3346 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PrkcshO08795 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PrkcshO08795 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrkcshO08795 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrkcshO08795 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrkcshO08795 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PrkcshO08795 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrkcshO08795 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrkcshO08795 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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