Protein–RNA interactions for Protein: L7N257

BC117090, cDNA sequence BC1179090, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC117090L7N257 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
BC117090L7N257 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
BC117090L7N257 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
BC117090L7N257 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
BC117090L7N257 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
BC117090L7N257 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
BC117090L7N257 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
BC117090L7N257 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
BC117090L7N257 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
BC117090L7N257 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
BC117090L7N257 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
BC117090L7N257 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
BC117090L7N257 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
BC117090L7N257 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
BC117090L7N257 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
BC117090L7N257 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
BC117090L7N257 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
BC117090L7N257 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
BC117090L7N257 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
BC117090L7N257 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
BC117090L7N257 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
BC117090L7N257 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
BC117090L7N257 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
BC117090L7N257 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
BC117090L7N257 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
BC117090L7N257 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
BC117090L7N257 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
BC117090L7N257 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
BC117090L7N257 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
BC117090L7N257 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
BC117090L7N257 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
BC117090L7N257 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
BC117090L7N257 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
BC117090L7N257 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
BC117090L7N257 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
BC117090L7N257 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
BC117090L7N257 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
BC117090L7N257 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
BC117090L7N257 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
BC117090L7N257 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
BC117090L7N257 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
BC117090L7N257 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
BC117090L7N257 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
BC117090L7N257 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
BC117090L7N257 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
BC117090L7N257 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
BC117090L7N257 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
BC117090L7N257 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
BC117090L7N257 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
BC117090L7N257 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
BC117090L7N257 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
BC117090L7N257 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
BC117090L7N257 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
BC117090L7N257 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
BC117090L7N257 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
BC117090L7N257 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
BC117090L7N257 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
BC117090L7N257 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
BC117090L7N257 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
BC117090L7N257 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
BC117090L7N257 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
BC117090L7N257 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
BC117090L7N257 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
BC117090L7N257 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
BC117090L7N257 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
BC117090L7N257 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
BC117090L7N257 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
BC117090L7N257 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
BC117090L7N257 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
BC117090L7N257 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
BC117090L7N257 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
BC117090L7N257 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
BC117090L7N257 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
BC117090L7N257 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
BC117090L7N257 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
BC117090L7N257 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
BC117090L7N257 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
BC117090L7N257 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
BC117090L7N257 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
BC117090L7N257 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
BC117090L7N257 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
BC117090L7N257 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
BC117090L7N257 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
BC117090L7N257 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
BC117090L7N257 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
BC117090L7N257 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
BC117090L7N257 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
BC117090L7N257 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
BC117090L7N257 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
BC117090L7N257 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
BC117090L7N257 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
BC117090L7N257 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
BC117090L7N257 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
BC117090L7N257 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
BC117090L7N257 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
BC117090L7N257 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
BC117090L7N257 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
BC117090L7N257 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
BC117090L7N257 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
BC117090L7N257 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87 ms