Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Gm2035J3QP87 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm2035J3QP87 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms