Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms