Protein–RNA interactions for Protein: G3UW71

Vmn1r167, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r167G3UW71 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r167G3UW71 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r167G3UW71 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r167G3UW71 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r167G3UW71 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r167G3UW71 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r167G3UW71 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r167G3UW71 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r167G3UW71 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r167G3UW71 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r167G3UW71 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Vmn1r167G3UW71 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r167G3UW71 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r167G3UW71 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r167G3UW71 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r167G3UW71 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r167G3UW71 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r167G3UW71 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r167G3UW71 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r167G3UW71 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r167G3UW71 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r167G3UW71 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r167G3UW71 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r167G3UW71 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r167G3UW71 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r167G3UW71 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r167G3UW71 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r167G3UW71 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r167G3UW71 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r167G3UW71 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r167G3UW71 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r167G3UW71 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r167G3UW71 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r167G3UW71 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r167G3UW71 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r167G3UW71 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r167G3UW71 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r167G3UW71 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r167G3UW71 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r167G3UW71 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r167G3UW71 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r167G3UW71 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r167G3UW71 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r167G3UW71 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r167G3UW71 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r167G3UW71 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r167G3UW71 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r167G3UW71 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r167G3UW71 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r167G3UW71 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Vmn1r167G3UW71 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r167G3UW71 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r167G3UW71 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r167G3UW71 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r167G3UW71 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r167G3UW71 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r167G3UW71 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r167G3UW71 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r167G3UW71 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r167G3UW71 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r167G3UW71 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r167G3UW71 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r167G3UW71 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r167G3UW71 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r167G3UW71 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r167G3UW71 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r167G3UW71 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r167G3UW71 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r167G3UW71 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r167G3UW71 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r167G3UW71 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r167G3UW71 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r167G3UW71 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r167G3UW71 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r167G3UW71 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r167G3UW71 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r167G3UW71 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r167G3UW71 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r167G3UW71 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r167G3UW71 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r167G3UW71 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r167G3UW71 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r167G3UW71 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r167G3UW71 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r167G3UW71 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r167G3UW71 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r167G3UW71 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r167G3UW71 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r167G3UW71 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r167G3UW71 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r167G3UW71 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r167G3UW71 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r167G3UW71 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r167G3UW71 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r167G3UW71 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r167G3UW71 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Vmn1r167G3UW71 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vmn1r167G3UW71 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vmn1r167G3UW71 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Vmn1r167G3UW71 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms