Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Gm15003-201ENSMUST00000118884 446 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Gm16305-201ENSMUST00000140747 556 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Ndufc1-204ENSMUST00000193279 315 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Pradc1-204ENSMUST00000126805 953 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Gm23675-201ENSMUST00000157311 125 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Gm29135-201ENSMUST00000188411 612 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Usp9yF8VPU6 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Gm20773-202ENSMUST00000193306 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Lonp2-207ENSMUST00000163987 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Mir744-201ENSMUST00000103261 100 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Usp9yF8VPU6 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
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