Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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H2-M1F7CXU4 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
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H2-M1F7CXU4 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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H2-M1F7CXU4 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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H2-M1F7CXU4 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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H2-M1F7CXU4 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
H2-M1F7CXU4 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
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