Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Parp1-201ENSMUST00000027777 3873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Ctnnd1-212ENSMUST00000111686 6061 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Elmo3-201ENSMUST00000109375 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Gm38034-201ENSMUST00000193915 2069 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Actn2-203ENSMUST00000168193 2920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Gm26947-201ENSMUST00000182497 2929 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Olfr120-202ENSMUST00000207771 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Ddr2-201ENSMUST00000027985 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Vmn1r26-203ENSMUST00000228070 4419 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Hivep2-201ENSMUST00000015645 9763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Tmem255a-202ENSMUST00000089054 3311 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Bcat1-201ENSMUST00000032402 7833 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Mybpc3-201ENSMUST00000111430 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Zfp93-202ENSMUST00000108438 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Olfr462-202ENSMUST00000213672 2021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Krt222-201ENSMUST00000038214 2042 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Slc6a16-203ENSMUST00000213347 2865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Gm42462-201ENSMUST00000196543 1363 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Tcf23-201ENSMUST00000006818 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Tulp4-209ENSMUST00000149756 8784 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Dclk1-212ENSMUST00000199585 5196 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Nrg1-212ENSMUST00000208598 1778 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Agbl4-202ENSMUST00000097920 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Olfr56-206ENSMUST00000203810 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Msrb3-201ENSMUST00000092143 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Fam60a-211ENSMUST00000204435 2785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Nbr1-203ENSMUST00000103099 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Lrp1b-207ENSMUST00000142688 2911 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Tusc5-201ENSMUST00000062024 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Thsd7b-201ENSMUST00000040311 3895 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Stra6-213ENSMUST00000167479 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Gm29128-201ENSMUST00000186448 2858 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Amt-201ENSMUST00000035230 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Gm42931-201ENSMUST00000201009 760 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Gm44284-201ENSMUST00000203836 3444 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 D2hgdh-201ENSMUST00000097633 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Clasp1-212ENSMUST00000189262 6918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Slc7a14-201ENSMUST00000091259 8897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Zfp626-202ENSMUST00000205671 5329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Ptpre-205ENSMUST00000210833 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Cxcr2-201ENSMUST00000027372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Polr1e-204ENSMUST00000133157 2986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Tal2-201ENSMUST00000030124 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 A530021J07Rik-202ENSMUST00000207727 1406 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Olfr96-203ENSMUST00000214482 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Fam135b-201ENSMUST00000022953 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Gm26785-201ENSMUST00000181775 2914 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Ciao1-201ENSMUST00000003759 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Gm42899-201ENSMUST00000197034 2667 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Gm20538F6Z9R1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.7 ms