Protein–RNA interactions for Protein: F6VRJ8

Gm8247, Predicted gene 8247 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8247F6VRJ8 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm8247F6VRJ8 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms