Protein–RNA interactions for Protein: F6VAN0

Atf6, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 alpha, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6F6VAN0 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Atf6F6VAN0 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms