Protein–RNA interactions for Protein: E9QAE1

Nckap5, NCK-associated protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,909 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nckap5E9QAE1 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nckap5E9QAE1 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nckap5E9QAE1 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nckap5E9QAE1 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nckap5E9QAE1 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Nckap5E9QAE1 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nckap5E9QAE1 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nckap5E9QAE1 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nckap5E9QAE1 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nckap5E9QAE1 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nckap5E9QAE1 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nckap5E9QAE1 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Nckap5E9QAE1 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nckap5E9QAE1 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nckap5E9QAE1 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nckap5E9QAE1 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nckap5E9QAE1 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nckap5E9QAE1 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nckap5E9QAE1 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nckap5E9QAE1 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Nckap5E9QAE1 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nckap5E9QAE1 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nckap5E9QAE1 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nckap5E9QAE1 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nckap5E9QAE1 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nckap5E9QAE1 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nckap5E9QAE1 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Nckap5E9QAE1 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Nckap5E9QAE1 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nckap5E9QAE1 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nckap5E9QAE1 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nckap5E9QAE1 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nckap5E9QAE1 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nckap5E9QAE1 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Nckap5E9QAE1 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nckap5E9QAE1 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nckap5E9QAE1 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Nckap5E9QAE1 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nckap5E9QAE1 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nckap5E9QAE1 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nckap5E9QAE1 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nckap5E9QAE1 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nckap5E9QAE1 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nckap5E9QAE1 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nckap5E9QAE1 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nckap5E9QAE1 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nckap5E9QAE1 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nckap5E9QAE1 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nckap5E9QAE1 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Nckap5E9QAE1 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nckap5E9QAE1 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nckap5E9QAE1 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nckap5E9QAE1 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nckap5E9QAE1 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nckap5E9QAE1 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Nckap5E9QAE1 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nckap5E9QAE1 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nckap5E9QAE1 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Nckap5E9QAE1 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nckap5E9QAE1 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nckap5E9QAE1 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Nckap5E9QAE1 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Nckap5E9QAE1 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nckap5E9QAE1 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nckap5E9QAE1 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Nckap5E9QAE1 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nckap5E9QAE1 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nckap5E9QAE1 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nckap5E9QAE1 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nckap5E9QAE1 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nckap5E9QAE1 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nckap5E9QAE1 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nckap5E9QAE1 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Nckap5E9QAE1 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nckap5E9QAE1 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nckap5E9QAE1 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Nckap5E9QAE1 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nckap5E9QAE1 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nckap5E9QAE1 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Nckap5E9QAE1 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nckap5E9QAE1 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nckap5E9QAE1 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nckap5E9QAE1 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nckap5E9QAE1 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nckap5E9QAE1 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nckap5E9QAE1 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nckap5E9QAE1 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nckap5E9QAE1 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nckap5E9QAE1 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Nckap5E9QAE1 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nckap5E9QAE1 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nckap5E9QAE1 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nckap5E9QAE1 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nckap5E9QAE1 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Nckap5E9QAE1 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nckap5E9QAE1 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Nckap5E9QAE1 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nckap5E9QAE1 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Nckap5E9QAE1 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Nckap5E9QAE1 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms