Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9P8

Rdh16f1, RDH16 family member 1, mousemouse

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Length 317 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f1E9Q9P8 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
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Rdh16f1E9Q9P8 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
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Rdh16f1E9Q9P8 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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Rdh16f1E9Q9P8 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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Rdh16f1E9Q9P8 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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Rdh16f1E9Q9P8 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Rdh16f1E9Q9P8 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Rdh16f1E9Q9P8 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Rdh16f1E9Q9P8 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rdh16f1E9Q9P8 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Rdh16f1E9Q9P8 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Rdh16f1E9Q9P8 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Rdh16f1E9Q9P8 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rdh16f1E9Q9P8 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rdh16f1E9Q9P8 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rdh16f1E9Q9P8 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rdh16f1E9Q9P8 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rdh16f1E9Q9P8 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rdh16f1E9Q9P8 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rdh16f1E9Q9P8 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rdh16f1E9Q9P8 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rdh16f1E9Q9P8 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rdh16f1E9Q9P8 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rdh16f1E9Q9P8 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rdh16f1E9Q9P8 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rdh16f1E9Q9P8 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rdh16f1E9Q9P8 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rdh16f1E9Q9P8 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rdh16f1E9Q9P8 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rdh16f1E9Q9P8 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rdh16f1E9Q9P8 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rdh16f1E9Q9P8 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rdh16f1E9Q9P8 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rdh16f1E9Q9P8 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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