Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3L7

Gm20715, Predicted gene 20715, mousemouse

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Length 95 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20715E9Q3L7 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20715E9Q3L7 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20715E9Q3L7 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20715E9Q3L7 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20715E9Q3L7 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20715E9Q3L7 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20715E9Q3L7 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20715E9Q3L7 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20715E9Q3L7 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20715E9Q3L7 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20715E9Q3L7 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm20715E9Q3L7 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20715E9Q3L7 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20715E9Q3L7 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm20715E9Q3L7 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm20715E9Q3L7 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm20715E9Q3L7 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20715E9Q3L7 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20715E9Q3L7 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20715E9Q3L7 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20715E9Q3L7 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm20715E9Q3L7 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20715E9Q3L7 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20715E9Q3L7 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Gm20715E9Q3L7 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm20715E9Q3L7 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20715E9Q3L7 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20715E9Q3L7 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20715E9Q3L7 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20715E9Q3L7 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20715E9Q3L7 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20715E9Q3L7 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20715E9Q3L7 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20715E9Q3L7 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20715E9Q3L7 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20715E9Q3L7 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20715E9Q3L7 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm20715E9Q3L7 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20715E9Q3L7 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20715E9Q3L7 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20715E9Q3L7 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20715E9Q3L7 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Gm20715E9Q3L7 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20715E9Q3L7 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20715E9Q3L7 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20715E9Q3L7 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20715E9Q3L7 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20715E9Q3L7 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20715E9Q3L7 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20715E9Q3L7 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Gm20715E9Q3L7 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20715E9Q3L7 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20715E9Q3L7 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20715E9Q3L7 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Gm20715E9Q3L7 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm20715E9Q3L7 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Gm20715E9Q3L7 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20715E9Q3L7 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20715E9Q3L7 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Gm20715E9Q3L7 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20715E9Q3L7 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Gm20715E9Q3L7 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20715E9Q3L7 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Gm20715E9Q3L7 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20715E9Q3L7 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm20715E9Q3L7 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Gm20715E9Q3L7 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms