Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Gm5870-201ENSMUST00000196461 282 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Sec13-201ENSMUST00000032440 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Samd13-202ENSMUST00000125965 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Mrpl24-204ENSMUST00000121920 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Gm29763-201ENSMUST00000205306 616 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Tnnt3-214ENSMUST00000105953 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Gm12453-201ENSMUST00000121981 331 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Nudt7-204ENSMUST00000134593 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Ndufc1-204ENSMUST00000193279 315 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Gm6855-201ENSMUST00000206307 790 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Olfr692-202ENSMUST00000217827 1126 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Olfr692-201ENSMUST00000098152 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc6D3YZP9 Smim8-204ENSMUST00000108133 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms