Protein–RNA interactions for Protein: D3YUH6

Ube2d4, Ubiquitin-conjugating enzyme E2D 4, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d4D3YUH6 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Ube2d4D3YUH6 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Ube2d4D3YUH6 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Ube2d4D3YUH6 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Ube2d4D3YUH6 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Ube2d4D3YUH6 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Ube2d4D3YUH6 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Ube2d4D3YUH6 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Ube2d4D3YUH6 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Ube2d4D3YUH6 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Ube2d4D3YUH6 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Ube2d4D3YUH6 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Ube2d4D3YUH6 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Ube2d4D3YUH6 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Ube2d4D3YUH6 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Ube2d4D3YUH6 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Ube2d4D3YUH6 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Ube2d4D3YUH6 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Ube2d4D3YUH6 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Ube2d4D3YUH6 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ube2d4D3YUH6 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ube2d4D3YUH6 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ube2d4D3YUH6 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ube2d4D3YUH6 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ube2d4D3YUH6 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ube2d4D3YUH6 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ube2d4D3YUH6 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ube2d4D3YUH6 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ube2d4D3YUH6 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ube2d4D3YUH6 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ube2d4D3YUH6 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Ube2d4D3YUH6 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Ube2d4D3YUH6 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ube2d4D3YUH6 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ube2d4D3YUH6 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ube2d4D3YUH6 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ube2d4D3YUH6 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ube2d4D3YUH6 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ube2d4D3YUH6 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ube2d4D3YUH6 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ube2d4D3YUH6 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ube2d4D3YUH6 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ube2d4D3YUH6 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Ube2d4D3YUH6 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ube2d4D3YUH6 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ube2d4D3YUH6 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ube2d4D3YUH6 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ube2d4D3YUH6 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Ube2d4D3YUH6 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ube2d4D3YUH6 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ube2d4D3YUH6 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Ube2d4D3YUH6 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ube2d4D3YUH6 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ube2d4D3YUH6 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ube2d4D3YUH6 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ube2d4D3YUH6 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ube2d4D3YUH6 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ube2d4D3YUH6 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ube2d4D3YUH6 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ube2d4D3YUH6 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ube2d4D3YUH6 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ube2d4D3YUH6 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ube2d4D3YUH6 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ube2d4D3YUH6 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ube2d4D3YUH6 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ube2d4D3YUH6 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ube2d4D3YUH6 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ube2d4D3YUH6 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Ube2d4D3YUH6 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ube2d4D3YUH6 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ube2d4D3YUH6 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ube2d4D3YUH6 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Ube2d4D3YUH6 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ube2d4D3YUH6 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ube2d4D3YUH6 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ube2d4D3YUH6 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ube2d4D3YUH6 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ube2d4D3YUH6 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ube2d4D3YUH6 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ube2d4D3YUH6 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ube2d4D3YUH6 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ube2d4D3YUH6 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ube2d4D3YUH6 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ube2d4D3YUH6 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ube2d4D3YUH6 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ube2d4D3YUH6 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ube2d4D3YUH6 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ube2d4D3YUH6 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ube2d4D3YUH6 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Ube2d4D3YUH6 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ube2d4D3YUH6 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ube2d4D3YUH6 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Ube2d4D3YUH6 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Ube2d4D3YUH6 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ube2d4D3YUH6 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ube2d4D3YUH6 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ube2d4D3YUH6 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ube2d4D3YUH6 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ube2d4D3YUH6 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ube2d4D3YUH6 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms