Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

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Length 197 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rd3lB2RV38 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rd3lB2RV38 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Rd3lB2RV38 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Rd3lB2RV38 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Rd3lB2RV38 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rd3lB2RV38 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Rd3lB2RV38 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rd3lB2RV38 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rd3lB2RV38 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rd3lB2RV38 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rd3lB2RV38 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Rd3lB2RV38 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Rd3lB2RV38 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rd3lB2RV38 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rd3lB2RV38 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Rd3lB2RV38 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Rd3lB2RV38 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Rd3lB2RV38 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Rd3lB2RV38 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rd3lB2RV38 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Rd3lB2RV38 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Rd3lB2RV38 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rd3lB2RV38 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rd3lB2RV38 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Rd3lB2RV38 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rd3lB2RV38 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rd3lB2RV38 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rd3lB2RV38 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rd3lB2RV38 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rd3lB2RV38 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rd3lB2RV38 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rd3lB2RV38 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rd3lB2RV38 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rd3lB2RV38 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rd3lB2RV38 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rd3lB2RV38 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rd3lB2RV38 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rd3lB2RV38 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rd3lB2RV38 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms