Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Rrn3B2RS91 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Rrn3B2RS91 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms