Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Prr9-201ENSMUST00000070284 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Brpf1B2RRD7 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms