Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Uhrf1bp1B2KF50 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Uhrf1bp1B2KF50 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Uhrf1bp1B2KF50 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Uhrf1bp1B2KF50 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Uhrf1bp1B2KF50 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Uhrf1bp1B2KF50 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Uhrf1bp1B2KF50 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Uhrf1bp1B2KF50 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Uhrf1bp1B2KF50 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Uhrf1bp1B2KF50 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Uhrf1bp1B2KF50 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Uhrf1bp1B2KF50 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Uhrf1bp1B2KF50 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Uhrf1bp1B2KF50 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Uhrf1bp1B2KF50 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Uhrf1bp1B2KF50 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Uhrf1bp1B2KF50 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Uhrf1bp1B2KF50 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Uhrf1bp1B2KF50 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Uhrf1bp1B2KF50 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Uhrf1bp1B2KF50 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Uhrf1bp1B2KF50 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Uhrf1bp1B2KF50 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Uhrf1bp1B2KF50 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Uhrf1bp1B2KF50 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Uhrf1bp1B2KF50 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Uhrf1bp1B2KF50 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Uhrf1bp1B2KF50 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Uhrf1bp1B2KF50 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Uhrf1bp1B2KF50 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Uhrf1bp1B2KF50 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Uhrf1bp1B2KF50 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Uhrf1bp1B2KF50 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Uhrf1bp1B2KF50 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Uhrf1bp1B2KF50 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Uhrf1bp1B2KF50 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Uhrf1bp1B2KF50 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Uhrf1bp1B2KF50 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Uhrf1bp1B2KF50 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Uhrf1bp1B2KF50 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Uhrf1bp1B2KF50 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Uhrf1bp1B2KF50 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Uhrf1bp1B2KF50 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Uhrf1bp1B2KF50 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Uhrf1bp1B2KF50 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Uhrf1bp1B2KF50 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Uhrf1bp1B2KF50 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Uhrf1bp1B2KF50 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Uhrf1bp1B2KF50 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Uhrf1bp1B2KF50 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Uhrf1bp1B2KF50 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Uhrf1bp1B2KF50 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Uhrf1bp1B2KF50 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Uhrf1bp1B2KF50 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Uhrf1bp1B2KF50 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Uhrf1bp1B2KF50 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Uhrf1bp1B2KF50 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Uhrf1bp1B2KF50 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Uhrf1bp1B2KF50 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Uhrf1bp1B2KF50 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Uhrf1bp1B2KF50 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Uhrf1bp1B2KF50 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Uhrf1bp1B2KF50 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Uhrf1bp1B2KF50 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Uhrf1bp1B2KF50 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Uhrf1bp1B2KF50 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Uhrf1bp1B2KF50 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Uhrf1bp1B2KF50 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Uhrf1bp1B2KF50 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Uhrf1bp1B2KF50 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Uhrf1bp1B2KF50 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Uhrf1bp1B2KF50 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Uhrf1bp1B2KF50 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Uhrf1bp1B2KF50 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Uhrf1bp1B2KF50 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms