Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

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Length 919 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Grik3B1AS29 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Grik3B1AS29 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms