Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB1

Ccdc183, Coiled-coil domain-containing protein 183, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc183A2AJB1 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc183A2AJB1 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc183A2AJB1 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc183A2AJB1 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc183A2AJB1 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc183A2AJB1 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc183A2AJB1 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc183A2AJB1 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc183A2AJB1 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc183A2AJB1 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc183A2AJB1 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc183A2AJB1 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc183A2AJB1 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc183A2AJB1 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc183A2AJB1 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc183A2AJB1 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc183A2AJB1 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc183A2AJB1 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc183A2AJB1 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc183A2AJB1 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc183A2AJB1 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc183A2AJB1 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc183A2AJB1 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc183A2AJB1 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc183A2AJB1 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc183A2AJB1 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc183A2AJB1 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc183A2AJB1 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc183A2AJB1 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc183A2AJB1 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc183A2AJB1 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc183A2AJB1 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc183A2AJB1 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc183A2AJB1 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc183A2AJB1 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc183A2AJB1 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc183A2AJB1 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc183A2AJB1 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc183A2AJB1 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc183A2AJB1 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc183A2AJB1 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc183A2AJB1 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc183A2AJB1 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc183A2AJB1 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc183A2AJB1 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc183A2AJB1 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc183A2AJB1 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc183A2AJB1 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc183A2AJB1 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc183A2AJB1 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc183A2AJB1 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc183A2AJB1 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc183A2AJB1 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc183A2AJB1 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Ccdc183A2AJB1 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc183A2AJB1 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Ccdc183A2AJB1 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Ccdc183A2AJB1 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc183A2AJB1 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc183A2AJB1 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc183A2AJB1 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc183A2AJB1 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc183A2AJB1 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc183A2AJB1 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc183A2AJB1 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc183A2AJB1 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc183A2AJB1 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc183A2AJB1 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc183A2AJB1 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc183A2AJB1 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc183A2AJB1 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc183A2AJB1 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc183A2AJB1 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc183A2AJB1 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc183A2AJB1 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc183A2AJB1 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc183A2AJB1 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc183A2AJB1 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc183A2AJB1 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc183A2AJB1 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc183A2AJB1 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc183A2AJB1 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Ccdc183A2AJB1 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms