Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
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