Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Top3bQ9Z321 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 137.7 ms