Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1J2

Nek4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, mousemouse

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Length 792 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek4Q9Z1J2 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nek4Q9Z1J2 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms