Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV85

Nme3, Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3Q9WV85 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nme3Q9WV85 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nme3Q9WV85 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nme3Q9WV85 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nme3Q9WV85 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nme3Q9WV85 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nme3Q9WV85 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nme3Q9WV85 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nme3Q9WV85 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nme3Q9WV85 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nme3Q9WV85 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nme3Q9WV85 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nme3Q9WV85 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nme3Q9WV85 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nme3Q9WV85 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nme3Q9WV85 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nme3Q9WV85 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nme3Q9WV85 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nme3Q9WV85 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Nme3Q9WV85 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms