Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUZ7

Sh3bgr, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrQ9WUZ7 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sh3bgrQ9WUZ7 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sh3bgrQ9WUZ7 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms