Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trpc2Q9R244 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms