Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q6

Arpc1a, Actin-related protein 2/3 complex subunit 1A, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arpc1aQ9R0Q6 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arpc1aQ9R0Q6 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arpc1aQ9R0Q6 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arpc1aQ9R0Q6 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arpc1aQ9R0Q6 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Arpc1aQ9R0Q6 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arpc1aQ9R0Q6 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arpc1aQ9R0Q6 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arpc1aQ9R0Q6 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arpc1aQ9R0Q6 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arpc1aQ9R0Q6 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arpc1aQ9R0Q6 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arpc1aQ9R0Q6 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arpc1aQ9R0Q6 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arpc1aQ9R0Q6 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arpc1aQ9R0Q6 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arpc1aQ9R0Q6 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arpc1aQ9R0Q6 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Arpc1aQ9R0Q6 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arpc1aQ9R0Q6 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arpc1aQ9R0Q6 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Arpc1aQ9R0Q6 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arpc1aQ9R0Q6 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arpc1aQ9R0Q6 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arpc1aQ9R0Q6 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arpc1aQ9R0Q6 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arpc1aQ9R0Q6 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arpc1aQ9R0Q6 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arpc1aQ9R0Q6 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arpc1aQ9R0Q6 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arpc1aQ9R0Q6 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arpc1aQ9R0Q6 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Arpc1aQ9R0Q6 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Arpc1aQ9R0Q6 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Arpc1aQ9R0Q6 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Arpc1aQ9R0Q6 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Arpc1aQ9R0Q6 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Arpc1aQ9R0Q6 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Arpc1aQ9R0Q6 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Arpc1aQ9R0Q6 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Arpc1aQ9R0Q6 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Arpc1aQ9R0Q6 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Arpc1aQ9R0Q6 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arpc1aQ9R0Q6 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arpc1aQ9R0Q6 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arpc1aQ9R0Q6 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arpc1aQ9R0Q6 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arpc1aQ9R0Q6 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arpc1aQ9R0Q6 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arpc1aQ9R0Q6 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arpc1aQ9R0Q6 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arpc1aQ9R0Q6 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arpc1aQ9R0Q6 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arpc1aQ9R0Q6 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arpc1aQ9R0Q6 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arpc1aQ9R0Q6 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arpc1aQ9R0Q6 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Arpc1aQ9R0Q6 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
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Arpc1aQ9R0Q6 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Arpc1aQ9R0Q6 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arpc1aQ9R0Q6 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arpc1aQ9R0Q6 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Arpc1aQ9R0Q6 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arpc1aQ9R0Q6 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arpc1aQ9R0Q6 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Arpc1aQ9R0Q6 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arpc1aQ9R0Q6 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arpc1aQ9R0Q6 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arpc1aQ9R0Q6 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arpc1aQ9R0Q6 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arpc1aQ9R0Q6 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arpc1aQ9R0Q6 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arpc1aQ9R0Q6 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Arpc1aQ9R0Q6 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arpc1aQ9R0Q6 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arpc1aQ9R0Q6 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arpc1aQ9R0Q6 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Arpc1aQ9R0Q6 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Arpc1aQ9R0Q6 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Arpc1aQ9R0Q6 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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