Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

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Length 557 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Gpc1Q9QZF2 Nme5-201ENSMUST00000079287 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Gpc1Q9QZF2 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gpc1Q9QZF2 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gpc1Q9QZF2 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gpc1Q9QZF2 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Gpc1Q9QZF2 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gpc1Q9QZF2 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gpc1Q9QZF2 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gpc1Q9QZF2 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Gpc1Q9QZF2 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Gpc1Q9QZF2 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Gpc1Q9QZF2 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gpc1Q9QZF2 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gpc1Q9QZF2 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gpc1Q9QZF2 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gpc1Q9QZF2 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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Gpc1Q9QZF2 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gpc1Q9QZF2 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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Gpc1Q9QZF2 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gpc1Q9QZF2 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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Gpc1Q9QZF2 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gpc1Q9QZF2 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gpc1Q9QZF2 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gpc1Q9QZF2 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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Gpc1Q9QZF2 1700023C21Rik-201ENSMUST00000143247 389 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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Gpc1Q9QZF2 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gpc1Q9QZF2 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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Gpc1Q9QZF2 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gpc1Q9QZF2 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gpc1Q9QZF2 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gpc1Q9QZF2 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gpc1Q9QZF2 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gpc1Q9QZF2 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gpc1Q9QZF2 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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Gpc1Q9QZF2 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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Gpc1Q9QZF2 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gpc1Q9QZF2 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gpc1Q9QZF2 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gpc1Q9QZF2 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gpc1Q9QZF2 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gpc1Q9QZF2 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gpc1Q9QZF2 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gpc1Q9QZF2 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
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Gpc1Q9QZF2 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Gpc1Q9QZF2 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gpc1Q9QZF2 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Gpc1Q9QZF2 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gpc1Q9QZF2 Btf3-205ENSMUST00000152704 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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