Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

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Length 917 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
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Ercc4Q9QZD4 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ercc4Q9QZD4 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ercc4Q9QZD4 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ercc4Q9QZD4 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Ercc4Q9QZD4 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Ercc4Q9QZD4 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ercc4Q9QZD4 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Ercc4Q9QZD4 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Ercc4Q9QZD4 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ercc4Q9QZD4 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ercc4Q9QZD4 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ercc4Q9QZD4 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ercc4Q9QZD4 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ercc4Q9QZD4 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ercc4Q9QZD4 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ercc4Q9QZD4 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ercc4Q9QZD4 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ercc4Q9QZD4 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ercc4Q9QZD4 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ercc4Q9QZD4 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ercc4Q9QZD4 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ercc4Q9QZD4 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ercc4Q9QZD4 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ercc4Q9QZD4 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ercc4Q9QZD4 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ercc4Q9QZD4 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ercc4Q9QZD4 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ercc4Q9QZD4 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ercc4Q9QZD4 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ercc4Q9QZD4 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ercc4Q9QZD4 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ercc4Q9QZD4 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ercc4Q9QZD4 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ercc4Q9QZD4 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ercc4Q9QZD4 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ercc4Q9QZD4 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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Ercc4Q9QZD4 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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Ercc4Q9QZD4 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ercc4Q9QZD4 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ercc4Q9QZD4 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ercc4Q9QZD4 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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Ercc4Q9QZD4 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ercc4Q9QZD4 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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Ercc4Q9QZD4 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ercc4Q9QZD4 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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Ercc4Q9QZD4 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ercc4Q9QZD4 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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Ercc4Q9QZD4 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ercc4Q9QZD4 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ercc4Q9QZD4 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Ercc4Q9QZD4 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Ercc4Q9QZD4 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ercc4Q9QZD4 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ercc4Q9QZD4 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ercc4Q9QZD4 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ercc4Q9QZD4 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Ercc4Q9QZD4 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Ercc4Q9QZD4 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ercc4Q9QZD4 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ercc4Q9QZD4 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Ercc4Q9QZD4 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ercc4Q9QZD4 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ercc4Q9QZD4 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ercc4Q9QZD4 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ercc4Q9QZD4 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
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